子宫内膜异位症的可能因解剖结构的改变，卵巢周围粘连，前列腺素增多，免疫功能的变化等原因导致女性不孕，LUFS（黄素化未破裂卵泡综合征）内分泌异常：如高泌乳素，18－79%内异症患者合并LUFS对卵巢功能的影响，导致卵子质量不佳与胚胎质量下，降黄体功能不全约占30%。
子宫内膜异位症的治疗主要包括期待疗法、药物疗法、手术治疗、辅助生育治疗等。
治疗内异症的常用药物：西药主要包括短效避孕药（如达英35、优思明等）、高效孕激素、达那唑、孕三烯酮、促性腺激素释放激素激动剂（GnRHa）等。中药包括方剂或中成药（如散结镇痛胶囊）等。
手术治疗包含腹腔镜手术、开腹手术等，根据患者自身情况及意愿选择保留生育功能手术、保留卵巢功能手术、根治性手术。子宫内膜异位症不孕症的微创手术治疗要彻底清除病灶，分离粘连，恢复解剖，剔除卵巢内异症囊肿时特别注意保护卵巢正常组织，首先冲洗囊腔尽量避免囊液外流，创面点凝或不凝，皮质尽量缝合。
年轻未生育患者疑诊子宫内膜异位症一般包括妇科检查（直肠或阴道检查）、影像学检查，药物治疗无效者应当行腹腔镜检查。治疗时应关注不孕症患者的卵巢功能，多学科综合决策，以患者为中心。
早期治疗：
1）非甾体抗炎药，替代性疼痛疗法和心理治疗。
2）激素药物<
3）促性腺激素释放激素动剂（青少年16岁以上）
4）手术治疗
早期诊治在青春期可能会延缓疾病的进展并预防不孕，根据患者个体情况选择处理方式，积极治疗：手术；促排卵；体外受精；GnRHa的应用。由于内异症属于进展性疾病，易于复发所以对内异症性不孕，不能单纯采用期待治疗。
