对于卵巢早衰的患者来说，最重要的治疗就是雌孕激素替代治疗，目的是为了缓解潮热，盗汗等类似更年期症状，并且预防远期的并发症，比如说骨质疏松，心血管疾病，老年痴呆等，还有要防止子宫的萎缩。
对于早衰的女性来说，患心血管疾病和骨质疏松的风险更高，所以他们可以从激素替代治疗中获益良多。所以因此卵巢早衰患者的治疗，因维持到正常的平均绝经年龄，55岁左右。
在治疗期间，需要患者定期复查体检。因为长期服用激素，乳腺和内膜患病的几率增高，所以其中包括乳腺和子宫内膜的检查。那么长期激素替代治疗会不会有副作用，甚至致癌呢？曾经的我们用的一些合成激素确实有增加高血压，高血脂和血栓的发生率。但是现在一些天然激素出现以后这个情况明显得到了扭转，补充天然的激素，不会增加高血压的风险，并且具有降血脂和降血糖的作用。
那么对于有子宫的卵巢早衰的患者，联合使用雌孕激素的治疗，其中孕激素的作用是避免子宫内膜过度增殖，所以还保留有子宫的患者，需要使用激素替代治疗，联合使用孕激素，降低子宫内膜癌的发生率，那么激素替代对乳腺癌的发病率有影响么？目前认为，疗程如果不超过15年的话，并不能增加乳腺癌的发生率。
