胎儿畸形与精子畸形病并不是一回事，精子畸形意味着它可能存在功能缺陷，很难突破卵子使其受精。如果精子畸形比例高，功能健全的有效精子就会减少，使女性受孕的几率变小。精子内部遗传物质才是影响到胚胎质量和流产的主要因素，单纯精子畸形率高，不会导致胎儿畸形率升高。如果部分畸形精子病患者存在病毒感染、生殖器感染、染色体异常等疾病，这种情况才可能畸形率升高。由此看来，精子畸形只是降低怀孕概率，不会导致胎儿畸形。
畸形精子症是男性不育的常见病因，精液优化处理技术包括密度梯度法、上游法等，均可回收到精子活力、形态较好及DNA损伤较少的精子，常用语畸形精子症所致不育的助孕治疗。根据精子正常形态率可将畸形精子症分为轻度、中度、重度；对于轻中度患者，男科医生会根据患者的实际情况进行药物治疗或应用人工授精技术进行治疗，中重度患者可考虑第一代或第二代试管婴儿技术进行助孕治疗。
