子宫内膜异位症在临床上主要表现为痛经，如果异味的内膜种植在神经分布密集处则疼痛明显，炎症表现为组织慢性炎，像类风湿关节炎一样，引起疼痛并导致组织纤维化，导致解剖结构变形。盆腔神经分布密集的部位主要在子宫及骶韧带及肠管，根据病灶种植在不同部位采取的治疗方法不同。如果病灶只局限在子宫，切除子宫上病灶就能解决问题，但病灶病灶往往分布比较广泛，因此术中必须全面探查，切除所有病灶才能解决疼痛。然而有时手术无法完全切除干净，药物治疗有时也是需要的。子宫内膜异位症发生的炎症是由性激素控制的，雌激素促进炎症反应，孕激素及雄激素抑制炎症反应。异位内膜腺体在雌激素作用下产生诱导炎症细胞反应的因子，雌激素必须通过内膜腺体细胞才能刺激炎症相关细胞发生反应。炎症反应还会牵连到子宫内膜，引起内膜无菌性炎症，内膜炎症会干扰胚胎着床，导致不孕或者流产，试管婴儿移植胚胎成功率低。在宫内放环避孕其原理就是引起内膜炎症反应。目前治疗目标就是打断这个炎症反应通路。相信不久将来这种疑难病将会得到很有效的治疗。
