精囊腺和前列腺的分泌物参与了精液的凝固与液化过程：精囊腺分泌的凝固蛋白促使精液凝固，而前列腺产生的蛋白酶系促使精液液化。一旦精囊腺或前列腺出现炎症刺激发生功能障碍或者先天缺如时，可使以上那些因子的分泌发生异常，造成凝固因子增多或液化因子减少，形成精液不液化症。
此外有研究表明，精液不液化与微量元素（如锌、铅等）也有很大关系，锌是人体中一种重要的微量元素，在前列腺液和精液中的含量明显高于其他组织和体液。锌含量在正常精液中大约相当于血浆中的100倍。精浆中锌浓度过低可抑制精液蛋白酶的活性，降低精液蛋白酶的液化作用，导致精液液化异常。铅是延迟精液液化时间的重金属之一，它可能是通过减少精浆中的抗氧化物和提高精子细胞膜的脂质过氧化水平，从而损伤精细胞表面结构。
不液化的精液在显微镜下可见精子聚集成堆，不能活动或只缓慢蠕动，这种精液中的精子在女性生殖道内的运动明显受到阻碍，精子难以上行进入子宫颈，从而引起不育。
