试管胚胎移植到底是用第三天胚胎好，还是用第五天囊胚好？根据的患者情况因人而已。选择不同的时期。
首先第三天鲜胚体外培养的时间比较短，可以获得较多的优质胚胎，但对胚胎的选择程度有限。胚胎的形态学不一定反映胚胎的活力，而且与正常生理情况下相比，胚胎过早的进入到宫腔里，与子宫内膜发育有可能不同步，胚胎在着床之前，会在宫腔里悬浮一段时间，继续培养至第五天增加了一次优选的过程，延长的囊胚培养导致部分染色体数目异常，且质量差的胚胎在体外发生了自然淘汰。对于本身胚胎数量比较少的患者来说，延长培养就会有无可利用的胚胎的风险。而对于获得较多胚胎的患者来说，则是优中选优，并且提高了胚胎，与子宫内膜的同步性，更加符合生理性的着床过程，移植的时间也处于黄体的中期，在这个时候女性生殖道宫颈黏液比较少，有利于移植手术的操作，并且子宫收缩也明显减少，大大减少了胚胎被排出体外的机会。囊胚期的胚胎体积更大，比较难向输卵管移动可以降低异位妊娠的发生率，由于提高了着床率，使得单囊胚移植成为可能，因此可以避免多胎妊娠的发生。总而言之，不同时期的胚胎移植各有优缺点，试管婴儿的，医生会根据不同患者的不同情况，选择不同时期的胚胎进行移植。
