卵巢囊肿严重与否取决于卵巢囊肿的类型，如单纯性卵巢囊肿或黄体囊肿。不用担心，因为可能是简单的囊肿，没有太多的危害和并发症，只要长得不是很大，一般来说不会引起器质性改变。但卵巢囊肿如果长到一定程度，有五、六公分，有些人在剧烈运动下会发生蒂扭转，引起急性下腹痛，此时就要手术处理。
还有一些囊肿像子宫内膜异位症囊肿，它会导致痛经，可能会有一些经期紊乱，最严重的一种是不孕不育，很多女性不能怀孕，这都和巧克力囊肿有关。此外，卵巢囊肿还有一些其它类型，这种就要因人而异了。
深圳武警医院生殖科邢琪主任提醒：单纯性的卵巢囊肿，没有明显的危害，一般都不会引起器质性改变，所以不用特殊处理。但是如果囊肿长到一定程度，达5-6公分，可能会在剧烈运动下出现蒂扭转，会导致下腹急性疼痛，需要第一时间做手术治疗。此外，因为子宫内膜异位症导致的巧克力囊肿，可能会导致女性月经痛经，月经不正常等情况，严重者会造成不孕症的发生。
