按照世界卫生组织定义，夫妇未采用任何避孕措施同居生活1年以上，由于男方因素造成女方不孕者，称为男性不育症。男性不育不是一种独立疾病，而是某一种或多种疾病或因素造成的结果。
男性不育患者，主要存在的问题，如果按照常见到不常见排序，主要包括：
第一类问题是精子异常，主要是少弱畸形精子症和无精子症。弱精子症最常见，就是精子活动力差，前向运动精子百分比低于32%；少精子症，就是精子密度或总数太少；畸形精子症，就是形态不正常的精子太多，正常形态精子所占的比例太低，这反映了精子整体的受精能力偏差；无精子症，就是射出精液中找不到精子。还有一些不育患者存在精子顶体反应异常、精子DNA碎片率过高等问题，精子顶体反应异常表明精子穿透卵子的能力差，精子DNA碎片率过高不仅会降低精子受精能力，还可能会造成受精后的胚胎质量差，容易出现胚胎停育和流产。
第二类问题是性功能障碍，严重的性功能障碍会造成男方不能把精液射入女方阴道，也就不能自然怀孕了。例如阴茎勃起功能障碍，俗称阳痿，表现为阴茎勃起困难或不坚硬，很难插入女方阴道完成性交，就更谈不上在女方阴道内射精了；严重的早泄患者会在阴茎插入女方阴道前就射精，不能把精液射入女方阴道；性交时射精困难的患者，经常是由于过度手淫，习惯了在手淫的刺激下射精，而不能在阴道内性交时射精，不能把精液射入女方阴道；逆行射精的患者，射精时精液没有向前经尿道射出体外，而是向后射到了膀胱或后尿道，表现为在射精时没有精液射出，而射完精排尿时会冲出一些精子；性欲过低的患者，由于性生活过少，也很难自然怀孕。
除了上述两类常见问题，还有一些跟生育相关的疾病，例如染色体异常、夫妇双方携带地中海贫血基因突变等，这些可能会造成女方复发性流产或胎儿异常。
