冷冻胚胎移植是辅助生殖中非常重要的一部分，在促排卵药物的作用下，病人经常能产生10多个甚至几十个成熟卵子，经过体外受精，包括卵细胞单精子注射，最后得到的胚胎往往能超过新鲜胚胎移植所需要用的数目，如何处理这些剩余的胚胎对病人来说是非常重要的，因为就目前的新鲜胚胎移植成功率来看，接近一半以上的病人并未在第一次的新鲜胚胎移植后就能怀孕，同时为了防止多胎受孕，目前越来越倾向于只移植1或2个胚胎，这就更需要将剩余的胚胎成功的冷冻保存起来，以后，病人就有可能不需要再通过药物促排卵获得胚胎，从而在一次促排卵后得到多次移植胚胎的机会，这不仅仅在经济上大大减轻病人的负担，也避免了反复促排卵对病人身体和精神的创伤。
冷冻胚胎还适用于很多情况，比如，在促排卵药物的作用下，常常会发生病人的过激现象，这时移植胚胎不仅仅着床率不高，而且一旦怀孕，也容易发生并发症，在这种情况下，胚胎冷冻就成为必须。另外，在子宫内膜没有处于最佳的着床状态时，将胚胎暂时冷冻起来留待至另一个更加的月经周期中移植，不失为一个更好的选择。还有当育龄妇女暂时不适合怀孕，而卵巢功能有即将丧失，比如不得不进行的放疗、化疗，在治疗前，可以将容易被放、化疗损伤的卵细胞取出，经过体外授精后，将胚胎予以冷冻保存，那么就算在进行了化疗后，病人仍有怀孕做母亲的可能。
